為使消毒效果達到理想要求，應選用微生物敏感的消毒劑，還應根據藥物的殺菌力、化學穩定性、刺激性和腐蝕性等加以選用。

1000ml消毒劑瓶

臨床宜選擇抗菌譜廣、殺菌力強、作用迅速、消毒持續時間長、效率受環境影響小、刺激性和腐蝕性較小、對人畜安全、廉價易得的消毒劑品種。

用于畜禽廄舍、糞池、污染場地、水源屠宰場等以及運輸工具、器械消毒等消毒的消毒劑通常可以用季銨鹽類、酚類消毒劑、醛類消毒劑、鹵素類消毒劑（如含氯石灰、復合亞氯酸鈉、溴氯海因、三氯異氰酸脲酸、二氯異氰酸脲酸鈉等）。

用于皮膚消毒時可使用苯扎溴銨、度米芬、乙醇、碘酊、氯已定，氯胺T、聚維酮碘、過氧化氫溶液等。

無論選用何種用途的消毒劑，選用時應仔細閱讀產品標簽或說明書。