氧化是中藥口服液在貯藏期間常出現的現象，是最常見的藥物反應之一。中藥口服液中成分的氧化，通常是在大氣中氧的影響下自動地進行緩慢的氧化過程。

250ml口服液瓶

藥物氧化的結果，不僅使成分含有量降低，而且可能顏色變深或析出沉淀，使中藥口服液成分更加復雜、難以控制，嚴重影響中藥口服液澄明度。富含雙鍵、羥基、醛基等結構成分的中藥口服液遇光、受熱、與氧氣接觸容易發生氧化反應，使藥液顏色加深、混濁、沉淀。絕大多數揮發油成分含酚醛活性基團以及其他一些含酚醛結構的提取部分穩定性差，在遇光及與氧氣接觸時，易被氧化，常常引起乳光，同時可能產生沉淀、色澤變深。九味羌活口服液在貯存過程中，容易出現澄明度問題，主要是由于該口服液中的揮發油等還原性成分穩定性差，當周圍環境條件適宜時，易被氧化產生沉淀。當周圍環境條件適宜時，易被氧化產生沉淀。

丹參素為酚酸類化合物，結構中含有鄰苯二羥基，在水溶液中鄰二酚羥基的電荷密度增大，易解離形成氧負離子，發生自動氧化生成有色醌類物質，使中藥口服液澄明度降低。綠原酸分子結構中含有的鄰二酚羥基，是酚酶催化最適的反應底物，受熱、見光易氧化，這是許多含綠原酸成分的中藥口服液在貯存過程中顏色加深的關鍵原因。鞣質類成分，特別是縮合鞣質，本身具有很強的還原性，和空氣接觸，在酶的作用下，容易氧化、脫水、縮合為暗棕紅色或紅棕色的鞣紅而形成沉淀。

在銀黃口服液滅菌前后有效成分變化的研究中發現，該口服液不宜長久儲存，放置時間越長，顏色越深，其原因是成品中含有具有鄰三酚羥基的黃芩素，易被氧化成醌類而顯綠色，使藥液顏色加深。