全身給藥又叫系統給藥，包括肌肉注射和靜脈注射兩種給藥途徑。當乳房嚴重腫脹時，乳導管系統被壓迫，或被炎性分泌物和細胞碎片阻塞，阻止乳房內注藥物到感染部位時，可采用用全身給藥治療奶牛乳房炎。在北歐，全身給藥廣泛用于治療所有類型的乳房炎但其他國家則更多地依據病情嚴重程度而定，如全身給藥常用于治療嚴重的臨床乳房炎或由金色葡萄球菌引起的乳房軟組織慢性感染。

5ml奶牛乳房注入器

一般認為，對于出現全身癥狀的乳房炎患牛，為治療乳房內感染，并控制或防止出現敗血癥或菌血癥，應通過肌肉注射或靜脈注射給藥，以進行全身性治療。用于全身治療乳房炎的理想藥物應是在肌注部位的生物利用度高，只能少量結合面求蛋白，脂溶性，并能在炎癥分泌物中連續發揮作用，表達抗乳房炎病原的抗菌活性。

高脂溶性藥物如大環內酯類、氟喹諾酮類、磺膠類、青霉素G乙胺酯等能通過上皮細胞，比較適合全身給藥治療乳房內細菌感染。另有資料表明，在炎癥過程中，鏈球菌性乳房炎和葡萄球菌性乳房炎可使乳房組織內的導管堵塞，這樣妨礙了乳池所給藥物的擴散，影響藥物發揮效，造成細菌學治愈率低。因而，提倡通過全身療法作為解決這些問題的方法或作為局部乳注療法的輔助措施，但有時也作為治療急性乳房炎的唯一方法。